未知物分析:在單四極桿GC/MS上鑒定譜庫中未收錄化合物的策略
GC/MS中的完全未知物的定性分析
GC/MS分析完全未知的化合物,是指未收錄于 GC/MS 數據庫中的化合物。
化合物的鑒定很重要,但傳統的鑒定方法十分繁瑣。
使用高分辨率質譜儀以獲取可能的分子式
可能需要進行 “軟” 電離。
運行串聯質譜(MS/MS)以幫助推斷結構。
分離出一定量的化合物,以便通過其他技術(核磁共振、紅外光譜等)進行分析。
購買 / 合成可能的化合物,運行 GC/MS,并匹配保留時間和質譜圖。
是否存在更快速、更經濟的方法?
單四極桿 GC/MS 分析中,有哪些方法可用于進行譜庫未收錄化合物的鑒定?
通過利用校準后的質譜數據獲得精確質量 / 譜圖準確度,從而得到分子式。
進行NIST的 “Hybrid Search”,該檢索方法可查找數據庫中不存在但相關的化合物。
利用AI預測的保留指數(NIST AIRI),通過保留指數進行確認或篩選。
四極桿上GC/MS的分子式鑒定——由MassWorks軟件輔助
校準后的Profile輪廓模式數據可提供良好的質量準確度(約 ±10 mDa),與譜圖準確度相結合,可實現幾 ppm 的有效質量準確度。
操作簡單。
以Profile輪廓模式運行數據。
在運行結束時短暫開啟質譜調諧液(全氟三丁胺,PFTBA)。
軟件會自動校準數據。
數據分析由MassWorks軟件來完成,最終得到精確質量和分子式。
四極桿GC/MS在Profile輪廓圖模式下測定化合物的精確質量,并通過理論同位素峰(綠色)和樣品校正同位素(紅色)的譜圖準確度識別出正確的分子式
混合檢索:Hybrid Search
Hybrid Search可匹配碎片離子和中性丟失。
通過納入 “近鄰” 化合物來擴展數據庫的范圍。
需要數據庫中存在相似的化合物。
必須知道名義分子量,最好還知道分子式。
質量差異必須局限于分子的單個區域,且分子的碎裂行為為沒有顯著變化。
Delta Mass 代表數據庫中化合物與未知分子之間的差異(修飾)。
混合檢索Hybrid search結果示例
保留指數校準
保留指數可以用于定性分析未知化合物,它比保留時間更可靠,因為它只與固定相類別和柱溫有關,受其他因素影響較小?。
保留指數通常可由正構烷系列混合標樣進樣后校正得到,還有一種新的方法——可以通過保留指數自動校正技術(如Auto RI,GC/ID)來計算保留指數。
保留指數定性的前提是已經有目標的保留指數相關的報道,這樣我們才能通過核對保留指數來定性。
NIST中譜庫中并不是每個化合物都有計算的保留指數值,但可以通過AIRI來預測化合物的保留指數。
正構烷烴系列混標校正計算保留指數
什么是 AIRI?
NIST 使用其廣泛的數據庫測量保留指數數據作為訓練集,通過化合物結構預測任何化合物的保留指數。
AIRI 的源代碼和模型由 NIST 發布。但是,設置過程很繁瑣。
Cerno Bioscience 公司正在開發基于網絡的應用程序,通過化合物結構預測保留指數,讓所有人都能輕松使用 AIRI。
AIRI的參考文獻: Predicting Retention Indices and Their Uncertainties Using Artificial Intelligence, Geer, Stein, Mallard, and Slotta,Journal of Chemical Information and Modeling 2024 64 (3),690-696.
方法示例
13.88 分鐘處的未知峰很強且純凈:
盡管如此,但檢索結果卻很差:
我們可以使用校準后的GC/MS數據確定分子量和分子式:
AIRI預測保留指數:
Hybrid Search 混合檢索結果:
小結:
結合分子式鑒定、保留指數和Hybrid Search混合檢索,是一種在單四極桿 GC/MS 上進行未知物定性分析的簡單、快速的方法。
對于不適合混合檢索的情況:
我們仍然可以使用保留指數 + 分子式鑒定來篩選未知化合物潛的潛在候選物。
四極桿GC/MS的分子式鑒定由MassWorks軟件來完成。
碎片分析也可用于驗證鑒定結果(例如使用 NIST MS Interpreter)。
最終的化合物鑒定還是需要通過合成化合物來進行確證。
關于MassWorks 軟件
MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發的一款革命性的MS數據定性分析軟件,能幫助我們在低分辨率的四極桿GC/MS、LC/MS直接測定化合物的精確質量,并通過獨有的譜圖準確度概念確定出準確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質譜(TOF、Orbitrap)的定性分析。
關于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡稱:綠綿科技)以體現客戶服務價值為宗旨,以專業精神和技能為廣大實驗室分析工作者提供樣品前處理、樣品制備及分析、實驗數據精確分析和管理的全面解決方案,致力于協助客戶提高分析檢測的效率和水平。主要代理產品聯系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8
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